ACTA NATURAE, ТОМ 18 № 1 (2026)
Авторы: Самарская В. О., Государственный научный центр Институт биоорганической химии им. академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова РАН Бутырин Ф. А., Государственный научный центр Институт биоорганической химии им. академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова РАН Супрунова Т. П., ООО «Дока-Генные Технологии» Спеченкова Н. А., Государственный научный центр Институт биоорганической химии им. академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова РАН Тальянский М. Э., Государственный научный центр Институт биоорганической химии им. академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова РАН Калинина Н. О., Государственный научный центр Институт биоорганической химии им. академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова РАН; Московский государственный университет им. М. В. Ломоносова; Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А. Н. Белозерского
DOI: https://doi.org/10.32607/actanaturae.27830
Ключевые слова: картофель, вирусы картофеля, РНК-секвенирование, вирусный геном, сборка de novo, филогения, генетическое разнообразие, регионы РФ
Вирусные заболевания, снижающие урожайность, качество и сроки хранения картофеля, представляют серьезную проблему для продукции картофеля во всем мире, в том числе и в РФ.
В настоящей работе на материале, собранном на коммерческих полях картофеля, изучено распространение вирусов картофеля в 16 регионах Европейской части РФ и 2 регионах Уральского федерального округа. Полноразмерные геномы вирусов были собраны de novo на основе данных РНК-секвенирования нового поколения образцов РНК, выделенных из листьев и проростков клубней картофеля. Проведен филогенетический анализ выявленных вариантов вирусов, что позволило оценить их генетическое разнообразие и возможное происхождение.
Показано, что наиболее опасный и экономически важный Y вирус картофеля (PVY) распространен повсеместно и представлен только рекомбинантными вариантами, среди которых наиболее часто встречаются NTNa, NTNb и N-Wi. Вторым по частоте распространения является М вирус картофеля (PVM), который во многих случаях определяется совместно с S вирусом картофеля (PVS). В двух областях РФ показано присутствие вируса скручивания листьев картофеля (PLRV), который наряду с PVY является важным и опасным патогеном картофеля. Не менее чем в половине изученных образцов выявлены смешанные инфекции, наиболее частым было одновременное присутствие вирусов PVY и PVM (около трети всех образцов).
Данные о популяциях вирусов в РФ и актуальных изменениях в геномах РНК-содержащих вирусов картофеля, для которых характерен высокий уровень эволюционной изменчивости, используются для разработки инновационной стратегии защиты растений от вирусов, основанной на механизме РНК-интерференции, с применением дцРНК, специфичных к последовательности вирусного генома.
